De motsetningene i CSTO ble brakt til lys i desember, når medlemslandene - Armenia, Hviterussland, Kasakhstan, Kirgisistan, Russland og Tadsjikistan - ikke klarte å bli enige om en generalsekretær for å erstatte Russland sittende, Nikolay Bordyuzha. Stillingen ble satt til å rotere til en armensk kandidat, men dette ble utsatt til april da presidentene i Kasakhstan og Hviterussland ikke klarte å vise opp til organisasjonens oktober og desember 2016 topper henholdsvis hindre samlingene fra å oppnå et quorum.
Dette har lagt til mistanke om at Hviterussland og Kasakhstan prioritere spesielle bånd med Aserbajdsjan enn deres mer formell allianse med Armenia. Yerevan har vært frustrert de siste årene med CSTO allierte selge våpen til sin rival (og ikke-medlem), samt en mangel på reaksjon på militære hendelser langs Armenia-Aserbajdsjan grensen.
Disse mistankene ble ytterligere stoked etter en rapportert militære angrepet på 29 desember. Mens Armenia og Aserbajdsjan hverandre skylden andre for hendelsen, en aserbajdsjansk soldat kropp hentes på territoriet til Armenia støtter kravet om en aserbajdsjanske streiftog inn armensk land. Den utgående russiske generalsekretæren syntes å ta parti med Armenia, fordømte hendelsen som «en provokasjon». Men han trappet ned dager senere, og uttalelsen ble ikke gjentatt av andre CSTO medlemmer.
I eventuelle framtidige sammenstøt mellom armenske og aserbajdsjanske styrker, ville en armensk generalsekretær forventes å vedta en mer uforsonlige holdning. Dette er noe Hviterussland, Kasakhstan og selv Russland frykter - for å si ingenting av Aserbajdsjan.
Men det ironiske er at mens CSTO prøver å unngå å bli involvert i den armenske-aserbajdsjanske konflikten, kanskje sin dysfunctionality fortsatt dra den inn i pågående Nagorny Karabakh tvisten. Selv om det tvist faller utenfor CSTO er ansvarsområde, til fiaskoen virke avskrekkende mot gjentakende vold sammen Armenia-Aserbajdsjan grensen legger til de negative dynamikken rundt konflikten og øker den generelle usikkerheten i regionen. Dessuten er det stor risiko for at opptrapping mellom Aserbajdsjan og Nagorny Karabakh kunne smitte over i Armenia, ringer for en CSTO respons.
I tillegg til Russlands forsøk på å plassere CSTO som en motvekt til NATO ytterligere kan motvirke Armenia. Landet forsøker å balansere sin forsvars bånd mellom de to blokkene, og er den eneste CSTO medlem bidra til NATOs fredsbevarende operasjoner. Ble forholdet mellom de to blokkene for å få åpent konfronterende, ville det være en reell utfordring for Yerevan å manøvrere mellom de to.
Sannheten er at CSTO er en seremoniell del av armensk-russiske bilaterale relasjoner; det er den militære allianse med Russland som er ment å gjelde for Armenia sikkerhet. Dette reiser spørsmålet om hvorvidt det politiske, økonomiske og menneskelige kapital Armenia har investert i CSTO er verdt prisen for å bli sittende fast i en slik dysfunksjonell og ineffektiv militær blokk. For å få til selv og regionen, kan en tenke i forsvarspolitikken være i orden.
